2024年6月19日,北京大学第三医院临床盛行病学研究中心詹思延教授团队在中科院一区期刊《基因组医学》(Genome Medicine)在线揭晓关于慢性肾脏病多组学药物靶点的最新研究效果,论文问题为《整合多组学卵白质组和转录组确定慢性肾病和肾功效的新型治疗靶点》(Identifcation of novel therapeutic targets for chronic kidney disease and kidney function by integrating multi-omics proteome with transcriptome),该研究展现了多个慢性肾脏病治疗的潜在新靶点。
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慢性肾脏病(CKD)是一种严重的慢性疾病,影响全球高达10%的生齿。CKD患者通;崴孀挪〕淘鎏矶涣M⒚媪俣嘀植涣枷鲁〉奈:,包括心血管事务、终末期肾病、甚至殒命等。
然而,这种患病率高、预后较差的慢性疾病现在在临床上尚缺乏有用的治愈步伐,亟需更深入地识别能够调控CKD危害的潜在标记物,为CKD靶向治疗提供新的看法。
既往的全基因组关联研究(GWAS)已经确定了数百个与CKD和肾功效相关的位点,但由于遗传位点通常位于生物学机制的最上游,到实现临床治疗靶点的转化尚有很长的距离。现在的血浆卵白质组、转录组(mRNA)等可以实现对潜在靶标举行高通量剖析和判断,为新药靶点挖掘提供了主要的基础。
为此,研究团队整合了多个大型血浆卵白质组和转录组的GWAS数据,通过自主设计的综合性剖析战略,包括卵白组规模的孟德尔随机化剖析、转录组规模的孟德尔随机化剖析、共定位剖析等多种统计遗传学剖析要领,从多组学数据中筛选出对慢性肾脏病具有潜在影响的靶点,为CKD的治疗和新药研发提供了主要的参考依据。
研究团队汇总了Iceland、UK Biobank、Fenland等三个现在最大的卵白组学研究数据库,获取了凌驾3000种卵白质数据,使用卵白组规模的孟德尔随机化剖析和多重校正战略确定了32个与CKD亲近相关的要害卵白。
随后,研究团队将这32个卵白与29个响应的编码基因相匹配,通过整合多个转录组的数据,进一步验证这些卵白的编码基因在差别人体组织中的表达与CKD的相关性和潜在的脱靶效应。通过对更普遍的CKD下场举行验证剖析,本研究发明的卵白靶点与来自差别人群的慢性肾脏病、肾功效指标、肾功效转变、以及特定的CKD临床类型等多个表型均保存一定的相关性。
值得注重的是,该研究所报道的32个卵白靶点中,多个卵白与CKD泛起出高度“共定位”,数个靶点之间保存“卵白-卵白相互作用”,且这些卵白的编码基因主要富集在“免疫相关通路”中。
筛选的卵白靶点与普遍的CKD相关表型之间的关联效果
研究团队通过文献综述总结和比照先前的孟德尔随机化和视察性研究,确定了在本研究发明的32个靶点中,12个可以被先前的研究所证实,20个靶点为本研究的新发明。
詹思延教授团队恒久致力于药物盛行病学与临床盛行病学等相关研究,本研究效果为慢性肾脏病的靶向干预、多靶点团结治疗、免疫治疗以及新药研发等潜在的临床科研转化提供了证据支持。
ag8ag8集团博雅博士后司书成为该论文的第一作者,北京大学第三医院为第一完成单位,北京大学第三医院临床盛行病学研究中心主任詹思延教授为该论文的通讯作者。本研究获得了国家自然科学基金、北京市自然科学基金、国家资助博士后研究职员妄想等多个项目的资助。
原文链接:https://doi.org/10.1186/s13073-024-01356-x
第一作者
司书成
北京大学第三医院
临床盛行病学研究中心博士后
助理研究员
主要研究偏向:统计遗传学、药物盛行病学
通讯作者
詹思延
北京大学第三医院
临床盛行病学研究中心主任
教授、博士生导师
主要研究偏向:药物盛行病学、临床盛行病学与循证医学等
参考文献
1. Si, S., Liu, H., Xu, L. et al. Identification of novel therapeutic targets for chronic kidney disease and kidney function by integrating multi-omics proteome with transcriptome. Genome Med 16, 84 (2024).
(北京大学第三医院)